TM
GEN01
基因组学与变异分析
WGS / WES / 靶向 Panel 数据质控，SNV、Indel、CNV、SV 及胚系与体细胞变异检测和功能注释。
- 突变特征与驱动事件
- 遗传病 / 肿瘤研究
12+大技术服务方向
1 对 1资深分析师对接
100%分析流程可复现
0客户数据公有云上传
ABOUT XINZHISHEN
不止运行代码，
更理解科学问题
我们是一家专注于深度数据挖掘与定制化生物信息分析的技术服务商，服务医药企业、科研团队与临床研究项目。
不同于依赖标准化流水线的分析模式，鑫智申将核心资源集中于算法能力、项目经验与专家级人工解读。每个项目都从科学假设出发，围绕真实研发问题重新设计分析策略。
了解我们的工作方式TECHNICAL SERVICES
覆盖研发全链路的
分析与计算能力
服务按研究链路展开：从遗传变异与表达调控，到多组学、数据证据与临床统计，再延伸至医学 AI、抗体研发、结构模拟与量子化学计算。
QTL02
遗传统计与表达调控分析
eQTL / sQTL、GWAS、TWAS、精细定位、共定位与孟德尔随机化，解析遗传变异与表达调控的关联。
- 候选因果基因排序
- 遗传证据链整合
RNA03
转录组学深度分析
差异表达、GO / KEGG / GSEA 富集、WGCNA、可变剪接、新转录本与调控网络分析。
- 药效与毒理机制
- 生物标志物发现
SC04
单细胞与空间组学
细胞亚群注释、拟时序、细胞通讯、空间域识别、空间邻域互作及多模态数据整合。
- 肿瘤微环境
- 细胞状态与空间定位
MP05
蛋白质组与代谢组
差异分子鉴定、通路映射、分子互作网络、生物标志物筛选与转录-蛋白-代谢关联分析。
- 机制系统解析
- 多层数据整合
MIC06
宏基因组与微生物组
物种组成、多样性、功能基因注释及微生物与宿主免疫、代谢互作分析。
- 肠道菌群研究
- 感染机制研究
DB07
公共数据库与靶点验证
深挖 TCGA、GEO、ICGC、GTEx 等数据，完成表达谱、预后、遗传证据和独立队列验证。
- 研发立项与适应证拓展
- 竞争情报追踪
STAT08
临床统计与可视化
Kaplan-Meier 生存分析、Cox 比例风险回归、多变量分析、混杂因素校正及出版级图表定制。
- 严谨统计设计
- 期刊级视觉呈现
CUSTOM09
医学 AI、多模态与定制建模
面向医学影像、组学与临床数据开展深度学习、多模态融合、外部验证和可解释性分析。
- PyTorch / TensorFlow
- 透明代码与复现
AB10
抗体序列与成药性分析
CDR 与框架区注释、人源化评估、理化性质、翻译后修饰（PTM）风险、免疫原性与聚集倾向预测。
- 双特异性 / 多特异性 / ADC
- 序列到结构评估
3D11
结构生物信息学与分子模拟
蛋白质与复合物结构预测、同源建模、分子对接、分子动力学、关键残基识别及结合自由能估算。
- AlphaFold / Rosetta
- GROMACS / MM/PBSA
DFT12
DFT 计算与药物设计
小分子构象搜索与几何优化、前线分子轨道、分子静电势和反应性描述符分析，并结合虚拟筛选与 ADMET 预测。
- DFT / QM/MM
- 药物重定位与适应证拓展
WHY XINZHISHEN
小而精的团队，
深而稳的分析
把预算和时间真正投入到科学问题、算法策略与结果解读，而不是层层转交。
专家直连
项目全程由专属资深分析师对接，技术细节与研发目标保持一致。
按问题定制
从科学假设出发设计分析，不用固定流水线套用不同项目。
离线数据安全
客户数据在本地高性能工作站处理，承诺零公有云上传。
透明可复现
完整交付注释代码、固定参数、分析日志与中间结果，支持内部复核。
PROJECT WORKFLOW
每一步都可见，
每个结果都可追溯
清晰的里程碑和中期沟通机制，让分析路径随科学证据迭代，而不偏离项目目标。
- 01
需求沟通
确认研究背景、数据类型、样本量、目标与验收标准。
- 02
方案设计
制定个性化流程、时间节点与关键里程碑。
- 03
分析与中期反馈
完成质控与核心分析，依据初步证据灵活调整方向。
- 04
深度结果解读
形成完整报告、出版级图表与生物学机制解释。
- 05
交付与持续支持
交付代码、日志与中间文件，提供修改及后续答疑。
TECHNOLOGY & QUALITY
从工具选择到结果交付，建立全流程质量控制
我们持续追踪国际前沿方法，在适配具体数据与研究目标后引入项目。关键节点使用多种算法交叉验证，确保结论稳健。
GATK / ANNOVARPLINK / QTLtoolsR / BioconductorPython / scikit-learnPyTorch / TensorFlowSeurat / ScanpyAlphaFold / RosettaAutoDock / GROMACSGaussian / ORCAFastQC / MultiQC
QC四层质量保障
- 01原始数据质控完整评估数据质量与潜在偏差
- 02多算法交叉验证在关键节点检查结论稳健性
- 03固定环境与参数保证相同条件下结果完全复现
- 04全量日志与代码支持审计、复核与二次开发
APPLICATION CASES
复杂项目场景
与分析路径
以下案例按疾病机制与因果证据、转化与临床建模、分子设计与计算化学三层组织，用于说明我们如何构建跨数据、跨算法的证据链，不代表对具体客户项目或发表成果的公开披露。
01GENOME
疑难遗传病全基因组变异解析
联合 SNV / Indel、CNV、SV、线粒体变异与 HLA 分型，整合家系共分离、群体频率及表型本体证据。
方法Joint calling · ACMG/AMP · HPO · SV integration
输出候选致病事件优先级与验证路径02GENETIC CAUSALITY
从 GWAS 信号到药物靶点因果链
贯通精细定位、eQTL / sQTL 共定位、TWAS、孟德尔随机化及表型广泛性检验，区分因果基因与连锁伴随信号。
方法SuSiE · Coloc · TWAS · MR · PheWAS
支持靶点优先级、方向性与安全性判断03SPATIAL MULTIOMICS
肿瘤微环境时空多模态重建
整合多区域、治疗前后单细胞转录组、空间转录组与免疫受体组数据，校正批次和样本差异，解析克隆状态、空间生态位与细胞通讯。
方法scVI · Cell2location · NicheNet · TCR clonotype
定位免疫逃逸生态位与联合干预机会04DRUG RESPONSE
跨组学药物响应机制与标志物
联合转录、蛋白、代谢、突变及药敏表型，通过潜变量建模和网络传播分离药效主轴、耐药旁路与混杂因素。
方法MOFA+ · DIABLO · Network propagation · Mediation
形成可验证的响应标志物组合与机制假设05MEDICAL AI
影像—组学—临床多模态预测
开展弱监督特征学习、缺失模态处理、嵌套交叉验证、跨中心外部验证及模型校准，控制数据泄漏。
方法MIL · Multimodal fusion · SHAP · Calibration
交付可解释且可迁移的风险预测模型06CLINICAL EVIDENCE
多中心真实世界动态风险建模
处理时间依赖暴露、竞争风险、中心异质性和缺失数据，完成内部—外部交叉验证、校准及临床净获益评估。
方法Joint model · Fine–Gray · MICE · Decision curve
建立可审计的分层决策证据07ANTIBODY
抗体序列、结构与成药性联合评估
从 CDR / 框架区注释延伸至人源化、结构置信度、表面电荷、疏水斑块、PTM 风险、聚集和免疫原性评估。
方法Numbering · Structure ensemble · PTM · Developability
比较候选分子风险并指导序列优化08MOLECULAR SIMULATION
变构位点与耐药突变机制验证
结合口袋动态、增强采样、突变自由能和结合自由能分解，评估构象转换、关键残基网络及耐药突变影响。
方法Metadynamics · FEP · MM/PBSA · Markov state model
解释活性差异并支持先导化合物迭代09QM & DFT
酶反应机理与共价抑制剂设计
构建反应坐标并比较质子转移、亲核进攻和离去路径，联合过渡态搜索、溶剂效应及电子结构描述符。
方法QM/MM · DFT · TS search · IRC · NBO
识别控速步骤并评估反应性与选择性OUR COMMITMENT
交付不是终点，
研究结果经得起复核才是
- ✓结果可重复
所有分析在同等条件下可完整复现。
- ✓代码透明交付
提供完整、注释清晰的分析代码。
- ✓一次免费修改
原分析范围与科学问题不变时提供一次修改。
- ✓终身技术答疑
已交付项目持续提供技术咨询支持。
- ✓NDA 严格保密
法律与离线处理机制双重保护核心数据。
START A PROJECT
让我们从您的
科学问题开始
简要说明研究方向、数据类型与预期目标，我们将尽快与您确认可行的分析路径。
- 联系人
- Mr. Tu
- 邮箱
- xzsbio@yeah.net
- 地址
- 上海市嘉定区菊园新区环城路2222号6幢101室